Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPAL4Q0D2K0 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms