Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DDR1Q08345 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms