Protein–RNA interactions for Protein: Q03923

ZNF85, Zinc finger protein 85, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF85Q03923 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF85Q03923 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF85Q03923 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZNF85Q03923 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF85Q03923 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF85Q03923 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF85Q03923 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF85Q03923 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF85Q03923 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF85Q03923 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF85Q03923 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF85Q03923 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF85Q03923 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF85Q03923 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF85Q03923 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF85Q03923 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF85Q03923 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF85Q03923 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF85Q03923 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF85Q03923 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF85Q03923 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF85Q03923 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF85Q03923 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF85Q03923 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF85Q03923 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF85Q03923 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF85Q03923 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF85Q03923 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF85Q03923 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF85Q03923 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF85Q03923 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF85Q03923 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF85Q03923 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF85Q03923 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF85Q03923 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF85Q03923 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF85Q03923 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF85Q03923 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF85Q03923 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF85Q03923 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF85Q03923 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF85Q03923 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF85Q03923 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF85Q03923 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF85Q03923 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF85Q03923 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF85Q03923 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF85Q03923 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF85Q03923 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF85Q03923 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZNF85Q03923 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms