Protein–RNA interactions for Protein: Q03181

PPARD, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARDQ03181 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PPARDQ03181 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPARDQ03181 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms