Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms