Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ERVS71-1P61550 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms