Protein–RNA interactions for Protein: P59190

RAB15, Ras-related protein Rab-15, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB15P59190 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB15P59190 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB15P59190 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB15P59190 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB15P59190 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB15P59190 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB15P59190 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB15P59190 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB15P59190 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB15P59190 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB15P59190 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB15P59190 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB15P59190 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB15P59190 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB15P59190 AC005786.4-201ENST00000623369 682 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB15P59190 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB15P59190 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB15P59190 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB15P59190 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB15P59190 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB15P59190 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB15P59190 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB15P59190 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB15P59190 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB15P59190 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB15P59190 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB15P59190 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB15P59190 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB15P59190 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB15P59190 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB15P59190 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB15P59190 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB15P59190 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB15P59190 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB15P59190 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB15P59190 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB15P59190 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB15P59190 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB15P59190 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB15P59190 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB15P59190 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB15P59190 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB15P59190 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB15P59190 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB15P59190 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB15P59190 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB15P59190 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB15P59190 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB15P59190 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB15P59190 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB15P59190 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB15P59190 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB15P59190 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB15P59190 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB15P59190 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB15P59190 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB15P59190 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB15P59190 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB15P59190 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB15P59190 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB15P59190 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB15P59190 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB15P59190 AC124312.2-201ENST00000546615 427 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB15P59190 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB15P59190 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB15P59190 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB15P59190 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB15P59190 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB15P59190 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB15P59190 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB15P59190 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB15P59190 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB15P59190 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB15P59190 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB15P59190 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB15P59190 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB15P59190 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB15P59190 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB15P59190 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB15P59190 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB15P59190 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB15P59190 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB15P59190 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB15P59190 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB15P59190 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB15P59190 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB15P59190 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB15P59190 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB15P59190 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB15P59190 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB15P59190 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB15P59190 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB15P59190 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB15P59190 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB15P59190 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB15P59190 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB15P59190 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB15P59190 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB15P59190 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB15P59190 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms