Protein–RNA interactions for Protein: P52848

NDST1, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDST1P52848 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDST1P52848 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDST1P52848 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDST1P52848 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDST1P52848 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDST1P52848 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDST1P52848 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDST1P52848 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDST1P52848 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDST1P52848 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NDST1P52848 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NDST1P52848 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NDST1P52848 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NDST1P52848 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NDST1P52848 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NDST1P52848 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NDST1P52848 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NDST1P52848 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NDST1P52848 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NDST1P52848 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NDST1P52848 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NDST1P52848 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NDST1P52848 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NDST1P52848 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NDST1P52848 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NDST1P52848 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NDST1P52848 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NDST1P52848 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NDST1P52848 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NDST1P52848 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NDST1P52848 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NDST1P52848 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NDST1P52848 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NDST1P52848 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NDST1P52848 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NDST1P52848 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NDST1P52848 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NDST1P52848 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NDST1P52848 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NDST1P52848 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NDST1P52848 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NDST1P52848 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NDST1P52848 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NDST1P52848 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NDST1P52848 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NDST1P52848 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NDST1P52848 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NDST1P52848 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NDST1P52848 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NDST1P52848 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NDST1P52848 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NDST1P52848 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NDST1P52848 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NDST1P52848 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NDST1P52848 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NDST1P52848 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NDST1P52848 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NDST1P52848 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NDST1P52848 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NDST1P52848 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NDST1P52848 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NDST1P52848 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NDST1P52848 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NDST1P52848 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NDST1P52848 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NDST1P52848 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NDST1P52848 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NDST1P52848 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NDST1P52848 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NDST1P52848 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NDST1P52848 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NDST1P52848 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NDST1P52848 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NDST1P52848 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NDST1P52848 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NDST1P52848 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NDST1P52848 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NDST1P52848 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NDST1P52848 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NDST1P52848 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NDST1P52848 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NDST1P52848 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NDST1P52848 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NDST1P52848 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NDST1P52848 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NDST1P52848 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NDST1P52848 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NDST1P52848 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NDST1P52848 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NDST1P52848 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NDST1P52848 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NDST1P52848 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NDST1P52848 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NDST1P52848 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NDST1P52848 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NDST1P52848 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NDST1P52848 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NDST1P52848 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NDST1P52848 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NDST1P52848 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.5 ms