Protein–RNA interactions for Protein: P43119

PTGIR, Prostacyclin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGIRP43119 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTGIRP43119 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms