Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PPARGP37231 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PPARGP37231 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PPARGP37231 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PPARGP37231 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PPARGP37231 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
PPARGP37231 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PPARGP37231 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PPARGP37231 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PPARGP37231 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPARGP37231 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPARGP37231 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPARGP37231 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPARGP37231 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPARGP37231 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPARGP37231 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPARGP37231 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPARGP37231 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPARGP37231 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPARGP37231 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PPARGP37231 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PPARGP37231 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPARGP37231 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPARGP37231 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPARGP37231 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PPARGP37231 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPARGP37231 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPARGP37231 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPARGP37231 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPARGP37231 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PPARGP37231 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPARGP37231 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPARGP37231 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPARGP37231 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PPARGP37231 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPARGP37231 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPARGP37231 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPARGP37231 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPARGP37231 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPARGP37231 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPARGP37231 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPARGP37231 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PPARGP37231 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPARGP37231 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPARGP37231 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PPARGP37231 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPARGP37231 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPARGP37231 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPARGP37231 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPARGP37231 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPARGP37231 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPARGP37231 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPARGP37231 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPARGP37231 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPARGP37231 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPARGP37231 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPARGP37231 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPARGP37231 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPARGP37231 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPARGP37231 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPARGP37231 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPARGP37231 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPARGP37231 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPARGP37231 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPARGP37231 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PPARGP37231 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PPARGP37231 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPARGP37231 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPARGP37231 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPARGP37231 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPARGP37231 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPARGP37231 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPARGP37231 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPARGP37231 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPARGP37231 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPARGP37231 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPARGP37231 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPARGP37231 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PPARGP37231 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PPARGP37231 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PPARGP37231 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PPARGP37231 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PPARGP37231 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PPARGP37231 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PPARGP37231 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PPARGP37231 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PPARGP37231 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PPARGP37231 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PPARGP37231 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PPARGP37231 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PPARGP37231 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PPARGP37231 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PPARGP37231 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PPARGP37231 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PPARGP37231 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PPARGP37231 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PPARGP37231 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PPARGP37231 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PPARGP37231 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PPARGP37231 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms