Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNNB1P35222 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms