Protein–RNA interactions for Protein: P26951

IL3RA, Interleukin-3 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3RAP26951 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
IL3RAP26951 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
IL3RAP26951 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
IL3RAP26951 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
IL3RAP26951 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
IL3RAP26951 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
IL3RAP26951 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
IL3RAP26951 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
IL3RAP26951 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
IL3RAP26951 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
IL3RAP26951 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
IL3RAP26951 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
IL3RAP26951 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
IL3RAP26951 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
IL3RAP26951 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
IL3RAP26951 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
IL3RAP26951 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
IL3RAP26951 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
IL3RAP26951 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
IL3RAP26951 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
IL3RAP26951 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
IL3RAP26951 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
IL3RAP26951 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
IL3RAP26951 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
IL3RAP26951 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
IL3RAP26951 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
IL3RAP26951 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
IL3RAP26951 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
IL3RAP26951 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
IL3RAP26951 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
IL3RAP26951 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
IL3RAP26951 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
IL3RAP26951 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
IL3RAP26951 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
IL3RAP26951 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
IL3RAP26951 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
IL3RAP26951 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
IL3RAP26951 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
IL3RAP26951 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
IL3RAP26951 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
IL3RAP26951 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
IL3RAP26951 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
IL3RAP26951 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
IL3RAP26951 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
IL3RAP26951 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
IL3RAP26951 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
IL3RAP26951 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
IL3RAP26951 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
IL3RAP26951 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
IL3RAP26951 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
IL3RAP26951 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
IL3RAP26951 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
IL3RAP26951 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
IL3RAP26951 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
IL3RAP26951 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
IL3RAP26951 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
IL3RAP26951 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
IL3RAP26951 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
IL3RAP26951 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
IL3RAP26951 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
IL3RAP26951 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
IL3RAP26951 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
IL3RAP26951 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
IL3RAP26951 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
IL3RAP26951 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
IL3RAP26951 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
IL3RAP26951 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
IL3RAP26951 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
IL3RAP26951 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
IL3RAP26951 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
IL3RAP26951 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
IL3RAP26951 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
IL3RAP26951 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
IL3RAP26951 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
IL3RAP26951 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
IL3RAP26951 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
IL3RAP26951 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
IL3RAP26951 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
IL3RAP26951 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
IL3RAP26951 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
IL3RAP26951 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
IL3RAP26951 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
IL3RAP26951 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
IL3RAP26951 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
IL3RAP26951 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
IL3RAP26951 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
IL3RAP26951 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
IL3RAP26951 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
IL3RAP26951 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
IL3RAP26951 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
IL3RAP26951 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
IL3RAP26951 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
IL3RAP26951 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
IL3RAP26951 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
IL3RAP26951 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
IL3RAP26951 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
IL3RAP26951 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
IL3RAP26951 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
IL3RAP26951 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
IL3RAP26951 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms