Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PLNP26678 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PLNP26678 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PLNP26678 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PLNP26678 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
PLNP26678 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PLNP26678 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PLNP26678 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PLNP26678 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PLNP26678 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PLNP26678 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PLNP26678 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PLNP26678 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PLNP26678 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PLNP26678 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PLNP26678 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PLNP26678 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PLNP26678 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PLNP26678 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PLNP26678 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PLNP26678 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PLNP26678 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PLNP26678 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PLNP26678 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
PLNP26678 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PLNP26678 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PLNP26678 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PLNP26678 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PLNP26678 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PLNP26678 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PLNP26678 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PLNP26678 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PLNP26678 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PLNP26678 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
PLNP26678 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PLNP26678 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PLNP26678 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PLNP26678 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PLNP26678 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
PLNP26678 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PLNP26678 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PLNP26678 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PLNP26678 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PLNP26678 BAHCC1-201ENST00000307745 10342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PLNP26678 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PLNP26678 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PLNP26678 TXLNA-201ENST00000373609 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PLNP26678 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PLNP26678 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PLNP26678 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PLNP26678 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PLNP26678 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PLNP26678 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PLNP26678 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PLNP26678 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PLNP26678 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PLNP26678 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PLNP26678 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PLNP26678 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PLNP26678 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PLNP26678 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PLNP26678 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PLNP26678 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PLNP26678 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PLNP26678 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PLNP26678 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PLNP26678 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PLNP26678 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PLNP26678 MYLK-202ENST00000354792 7531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PLNP26678 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PLNP26678 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PLNP26678 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PLNP26678 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PLNP26678 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PLNP26678 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PLNP26678 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PLNP26678 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PLNP26678 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PLNP26678 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PLNP26678 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PLNP26678 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PLNP26678 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PLNP26678 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PLNP26678 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PLNP26678 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PLNP26678 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PLNP26678 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PLNP26678 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PLNP26678 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PLNP26678 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
PLNP26678 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PLNP26678 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PLNP26678 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PLNP26678 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
PLNP26678 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PLNP26678 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PLNP26678 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PLNP26678 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PLNP26678 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PLNP26678 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms