Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 CYP4F11-204ENST00000591841 2531 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 2998 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms