Protein–RNA interactions for Protein: P09327

VIL1, Villin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIL1P09327 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VIL1P09327 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VIL1P09327 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
VIL1P09327 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
VIL1P09327 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VIL1P09327 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VIL1P09327 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VIL1P09327 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VIL1P09327 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VIL1P09327 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VIL1P09327 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VIL1P09327 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VIL1P09327 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VIL1P09327 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VIL1P09327 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VIL1P09327 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VIL1P09327 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VIL1P09327 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VIL1P09327 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VIL1P09327 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VIL1P09327 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VIL1P09327 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VIL1P09327 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VIL1P09327 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
VIL1P09327 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VIL1P09327 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VIL1P09327 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VIL1P09327 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
VIL1P09327 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VIL1P09327 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VIL1P09327 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VIL1P09327 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VIL1P09327 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VIL1P09327 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VIL1P09327 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VIL1P09327 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VIL1P09327 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VIL1P09327 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
VIL1P09327 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
VIL1P09327 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VIL1P09327 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VIL1P09327 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VIL1P09327 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VIL1P09327 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VIL1P09327 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VIL1P09327 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VIL1P09327 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VIL1P09327 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VIL1P09327 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VIL1P09327 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VIL1P09327 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VIL1P09327 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VIL1P09327 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VIL1P09327 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VIL1P09327 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VIL1P09327 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VIL1P09327 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VIL1P09327 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VIL1P09327 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VIL1P09327 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VIL1P09327 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VIL1P09327 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VIL1P09327 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VIL1P09327 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VIL1P09327 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VIL1P09327 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VIL1P09327 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VIL1P09327 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
VIL1P09327 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VIL1P09327 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VIL1P09327 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VIL1P09327 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
VIL1P09327 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VIL1P09327 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VIL1P09327 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VIL1P09327 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VIL1P09327 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VIL1P09327 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VIL1P09327 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VIL1P09327 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VIL1P09327 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VIL1P09327 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VIL1P09327 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VIL1P09327 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VIL1P09327 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VIL1P09327 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VIL1P09327 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VIL1P09327 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VIL1P09327 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VIL1P09327 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VIL1P09327 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VIL1P09327 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VIL1P09327 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VIL1P09327 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VIL1P09327 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VIL1P09327 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
VIL1P09327 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VIL1P09327 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VIL1P09327 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VIL1P09327 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms