Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPBP07199 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPBP07199 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPBP07199 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPBP07199 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPBP07199 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPBP07199 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPBP07199 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPBP07199 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPBP07199 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPBP07199 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPBP07199 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPBP07199 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPBP07199 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPBP07199 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPBP07199 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPBP07199 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPBP07199 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPBP07199 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPBP07199 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPBP07199 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPBP07199 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPBP07199 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPBP07199 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPBP07199 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPBP07199 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPBP07199 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPBP07199 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPBP07199 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPBP07199 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPBP07199 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPBP07199 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPBP07199 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPBP07199 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPBP07199 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPBP07199 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPBP07199 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPBP07199 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPBP07199 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPBP07199 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPBP07199 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPBP07199 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPBP07199 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPBP07199 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPBP07199 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPBP07199 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPBP07199 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPBP07199 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPBP07199 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPBP07199 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPBP07199 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPBP07199 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPBP07199 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPBP07199 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPBP07199 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPBP07199 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPBP07199 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPBP07199 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPBP07199 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPBP07199 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CENPBP07199 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPBP07199 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPBP07199 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPBP07199 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPBP07199 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPBP07199 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPBP07199 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPBP07199 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPBP07199 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPBP07199 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPBP07199 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPBP07199 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPBP07199 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPBP07199 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPBP07199 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPBP07199 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPBP07199 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPBP07199 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPBP07199 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPBP07199 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPBP07199 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPBP07199 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPBP07199 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPBP07199 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPBP07199 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPBP07199 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPBP07199 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPBP07199 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPBP07199 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPBP07199 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPBP07199 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CENPBP07199 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CENPBP07199 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CENPBP07199 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CENPBP07199 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CENPBP07199 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CENPBP07199 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CENPBP07199 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CENPBP07199 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CENPBP07199 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms