Protein–RNA interactions for Protein: P04141

CSF2, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2P04141 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF2P04141 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF2P04141 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF2P04141 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF2P04141 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF2P04141 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF2P04141 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF2P04141 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF2P04141 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF2P04141 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF2P04141 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF2P04141 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF2P04141 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF2P04141 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF2P04141 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF2P04141 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF2P04141 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF2P04141 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF2P04141 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF2P04141 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF2P04141 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF2P04141 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF2P04141 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF2P04141 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF2P04141 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF2P04141 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF2P04141 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF2P04141 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF2P04141 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF2P04141 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF2P04141 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF2P04141 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF2P04141 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF2P04141 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF2P04141 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF2P04141 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF2P04141 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF2P04141 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF2P04141 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF2P04141 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF2P04141 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF2P04141 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF2P04141 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF2P04141 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF2P04141 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF2P04141 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF2P04141 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF2P04141 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF2P04141 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF2P04141 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF2P04141 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF2P04141 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF2P04141 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF2P04141 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF2P04141 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF2P04141 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF2P04141 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF2P04141 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF2P04141 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF2P04141 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF2P04141 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF2P04141 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF2P04141 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF2P04141 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF2P04141 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF2P04141 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF2P04141 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF2P04141 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF2P04141 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF2P04141 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF2P04141 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF2P04141 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF2P04141 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF2P04141 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF2P04141 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF2P04141 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF2P04141 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF2P04141 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF2P04141 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF2P04141 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF2P04141 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF2P04141 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF2P04141 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF2P04141 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF2P04141 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF2P04141 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF2P04141 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF2P04141 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF2P04141 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF2P04141 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF2P04141 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF2P04141 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF2P04141 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF2P04141 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF2P04141 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF2P04141 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF2P04141 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF2P04141 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF2P04141 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF2P04141 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms