Protein–RNA interactions for Protein: O95237

LRAT, Lecithin retinol acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRATO95237 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRATO95237 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRATO95237 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRATO95237 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRATO95237 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRATO95237 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRATO95237 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRATO95237 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRATO95237 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRATO95237 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRATO95237 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRATO95237 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRATO95237 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRATO95237 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRATO95237 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRATO95237 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRATO95237 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRATO95237 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRATO95237 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRATO95237 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRATO95237 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRATO95237 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRATO95237 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRATO95237 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LRATO95237 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRATO95237 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRATO95237 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LRATO95237 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LRATO95237 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LRATO95237 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRATO95237 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRATO95237 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRATO95237 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRATO95237 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRATO95237 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRATO95237 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRATO95237 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRATO95237 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRATO95237 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRATO95237 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRATO95237 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRATO95237 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRATO95237 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRATO95237 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRATO95237 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRATO95237 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRATO95237 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRATO95237 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRATO95237 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRATO95237 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRATO95237 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRATO95237 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRATO95237 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRATO95237 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRATO95237 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRATO95237 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRATO95237 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRATO95237 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRATO95237 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRATO95237 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRATO95237 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRATO95237 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRATO95237 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRATO95237 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRATO95237 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LRATO95237 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRATO95237 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRATO95237 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRATO95237 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRATO95237 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRATO95237 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRATO95237 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRATO95237 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRATO95237 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRATO95237 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LRATO95237 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRATO95237 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRATO95237 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRATO95237 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRATO95237 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRATO95237 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRATO95237 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRATO95237 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRATO95237 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRATO95237 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRATO95237 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRATO95237 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRATO95237 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRATO95237 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRATO95237 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRATO95237 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRATO95237 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRATO95237 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRATO95237 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRATO95237 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRATO95237 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRATO95237 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LRATO95237 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRATO95237 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRATO95237 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms