Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PPFIA3O75145 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms