Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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