Protein–RNA interactions for Protein: A4FU69

EFCAB5, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB5A4FU69 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
EFCAB5A4FU69 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EFCAB5A4FU69 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EFCAB5A4FU69 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
EFCAB5A4FU69 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EFCAB5A4FU69 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EFCAB5A4FU69 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EFCAB5A4FU69 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EFCAB5A4FU69 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EFCAB5A4FU69 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EFCAB5A4FU69 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
EFCAB5A4FU69 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
EFCAB5A4FU69 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EFCAB5A4FU69 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EFCAB5A4FU69 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EFCAB5A4FU69 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EFCAB5A4FU69 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EFCAB5A4FU69 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EFCAB5A4FU69 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EFCAB5A4FU69 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EFCAB5A4FU69 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EFCAB5A4FU69 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EFCAB5A4FU69 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
EFCAB5A4FU69 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EFCAB5A4FU69 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EFCAB5A4FU69 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EFCAB5A4FU69 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EFCAB5A4FU69 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EFCAB5A4FU69 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EFCAB5A4FU69 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EFCAB5A4FU69 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EFCAB5A4FU69 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EFCAB5A4FU69 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
EFCAB5A4FU69 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EFCAB5A4FU69 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EFCAB5A4FU69 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EFCAB5A4FU69 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EFCAB5A4FU69 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
EFCAB5A4FU69 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EFCAB5A4FU69 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EFCAB5A4FU69 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EFCAB5A4FU69 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EFCAB5A4FU69 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EFCAB5A4FU69 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EFCAB5A4FU69 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EFCAB5A4FU69 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EFCAB5A4FU69 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EFCAB5A4FU69 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EFCAB5A4FU69 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
EFCAB5A4FU69 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EFCAB5A4FU69 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EFCAB5A4FU69 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EFCAB5A4FU69 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
EFCAB5A4FU69 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
EFCAB5A4FU69 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EFCAB5A4FU69 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EFCAB5A4FU69 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EFCAB5A4FU69 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EFCAB5A4FU69 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
EFCAB5A4FU69 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EFCAB5A4FU69 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EFCAB5A4FU69 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EFCAB5A4FU69 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EFCAB5A4FU69 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EFCAB5A4FU69 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EFCAB5A4FU69 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EFCAB5A4FU69 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EFCAB5A4FU69 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EFCAB5A4FU69 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
EFCAB5A4FU69 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EFCAB5A4FU69 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EFCAB5A4FU69 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EFCAB5A4FU69 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EFCAB5A4FU69 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EFCAB5A4FU69 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
EFCAB5A4FU69 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EFCAB5A4FU69 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EFCAB5A4FU69 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
EFCAB5A4FU69 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EFCAB5A4FU69 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EFCAB5A4FU69 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EFCAB5A4FU69 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
EFCAB5A4FU69 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EFCAB5A4FU69 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EFCAB5A4FU69 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EFCAB5A4FU69 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EFCAB5A4FU69 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EFCAB5A4FU69 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EFCAB5A4FU69 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EFCAB5A4FU69 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EFCAB5A4FU69 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EFCAB5A4FU69 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EFCAB5A4FU69 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EFCAB5A4FU69 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EFCAB5A4FU69 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
EFCAB5A4FU69 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
EFCAB5A4FU69 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
EFCAB5A4FU69 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EFCAB5A4FU69 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EFCAB5A4FU69 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms