Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y244

POMP, Proteasome maturation protein, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMPQ9Y244 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
POMPQ9Y244 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms