Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVW-1Q9UQF0 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms