Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

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Length 774 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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HCN3Q9P1Z3 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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HCN3Q9P1Z3 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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HCN3Q9P1Z3 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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HCN3Q9P1Z3 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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HCN3Q9P1Z3 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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HCN3Q9P1Z3 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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HCN3Q9P1Z3 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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HCN3Q9P1Z3 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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HCN3Q9P1Z3 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HCN3Q9P1Z3 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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