Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GDE1Q9NZC3 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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