Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMBRD1Q9NUN5 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms