Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CHST12Q9NRB3 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms