Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4E5

RHOJ, Rho-related GTP-binding protein RhoJ, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOJQ9H4E5 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOJQ9H4E5 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOJQ9H4E5 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOJQ9H4E5 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOJQ9H4E5 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOJQ9H4E5 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOJQ9H4E5 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOJQ9H4E5 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOJQ9H4E5 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOJQ9H4E5 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOJQ9H4E5 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOJQ9H4E5 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOJQ9H4E5 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOJQ9H4E5 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOJQ9H4E5 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHOJQ9H4E5 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOJQ9H4E5 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOJQ9H4E5 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOJQ9H4E5 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOJQ9H4E5 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOJQ9H4E5 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOJQ9H4E5 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOJQ9H4E5 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOJQ9H4E5 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOJQ9H4E5 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOJQ9H4E5 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOJQ9H4E5 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOJQ9H4E5 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOJQ9H4E5 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOJQ9H4E5 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOJQ9H4E5 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOJQ9H4E5 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOJQ9H4E5 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOJQ9H4E5 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOJQ9H4E5 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOJQ9H4E5 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOJQ9H4E5 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOJQ9H4E5 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOJQ9H4E5 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOJQ9H4E5 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOJQ9H4E5 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOJQ9H4E5 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOJQ9H4E5 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOJQ9H4E5 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOJQ9H4E5 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOJQ9H4E5 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOJQ9H4E5 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOJQ9H4E5 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOJQ9H4E5 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOJQ9H4E5 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOJQ9H4E5 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOJQ9H4E5 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOJQ9H4E5 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOJQ9H4E5 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOJQ9H4E5 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOJQ9H4E5 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOJQ9H4E5 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOJQ9H4E5 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOJQ9H4E5 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOJQ9H4E5 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOJQ9H4E5 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOJQ9H4E5 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOJQ9H4E5 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOJQ9H4E5 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOJQ9H4E5 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOJQ9H4E5 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOJQ9H4E5 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOJQ9H4E5 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOJQ9H4E5 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOJQ9H4E5 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOJQ9H4E5 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOJQ9H4E5 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOJQ9H4E5 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOJQ9H4E5 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOJQ9H4E5 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOJQ9H4E5 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOJQ9H4E5 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOJQ9H4E5 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOJQ9H4E5 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOJQ9H4E5 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOJQ9H4E5 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOJQ9H4E5 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOJQ9H4E5 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOJQ9H4E5 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOJQ9H4E5 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOJQ9H4E5 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOJQ9H4E5 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOJQ9H4E5 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOJQ9H4E5 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOJQ9H4E5 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOJQ9H4E5 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOJQ9H4E5 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOJQ9H4E5 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOJQ9H4E5 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOJQ9H4E5 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOJQ9H4E5 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOJQ9H4E5 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOJQ9H4E5 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOJQ9H4E5 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOJQ9H4E5 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms