Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYS8

LRRC2, Leucine-rich repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC2Q9BYS8 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRC2Q9BYS8 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRC2Q9BYS8 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRC2Q9BYS8 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRC2Q9BYS8 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRC2Q9BYS8 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRC2Q9BYS8 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRC2Q9BYS8 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRC2Q9BYS8 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRC2Q9BYS8 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRC2Q9BYS8 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRC2Q9BYS8 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRC2Q9BYS8 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRC2Q9BYS8 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRRC2Q9BYS8 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC2Q9BYS8 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC2Q9BYS8 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC2Q9BYS8 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC2Q9BYS8 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC2Q9BYS8 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC2Q9BYS8 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC2Q9BYS8 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC2Q9BYS8 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC2Q9BYS8 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC2Q9BYS8 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC2Q9BYS8 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC2Q9BYS8 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC2Q9BYS8 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC2Q9BYS8 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC2Q9BYS8 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC2Q9BYS8 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC2Q9BYS8 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC2Q9BYS8 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC2Q9BYS8 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC2Q9BYS8 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC2Q9BYS8 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC2Q9BYS8 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC2Q9BYS8 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC2Q9BYS8 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC2Q9BYS8 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC2Q9BYS8 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC2Q9BYS8 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC2Q9BYS8 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC2Q9BYS8 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC2Q9BYS8 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC2Q9BYS8 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC2Q9BYS8 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRRC2Q9BYS8 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC2Q9BYS8 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC2Q9BYS8 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC2Q9BYS8 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC2Q9BYS8 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC2Q9BYS8 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC2Q9BYS8 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC2Q9BYS8 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC2Q9BYS8 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC2Q9BYS8 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC2Q9BYS8 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC2Q9BYS8 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC2Q9BYS8 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC2Q9BYS8 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC2Q9BYS8 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC2Q9BYS8 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC2Q9BYS8 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC2Q9BYS8 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC2Q9BYS8 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC2Q9BYS8 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC2Q9BYS8 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC2Q9BYS8 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC2Q9BYS8 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC2Q9BYS8 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC2Q9BYS8 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC2Q9BYS8 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC2Q9BYS8 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC2Q9BYS8 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC2Q9BYS8 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC2Q9BYS8 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC2Q9BYS8 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC2Q9BYS8 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC2Q9BYS8 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC2Q9BYS8 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC2Q9BYS8 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC2Q9BYS8 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC2Q9BYS8 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC2Q9BYS8 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC2Q9BYS8 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC2Q9BYS8 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC2Q9BYS8 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC2Q9BYS8 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC2Q9BYS8 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRRC2Q9BYS8 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC2Q9BYS8 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC2Q9BYS8 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC2Q9BYS8 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC2Q9BYS8 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC2Q9BYS8 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC2Q9BYS8 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC2Q9BYS8 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC2Q9BYS8 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRRC2Q9BYS8 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms