Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT76

UPK3B, Uroplakin-3b, humanhuman

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Length 320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BQ9BT76 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
UPK3BQ9BT76 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
UPK3BQ9BT76 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
UPK3BQ9BT76 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
UPK3BQ9BT76 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
UPK3BQ9BT76 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
UPK3BQ9BT76 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
UPK3BQ9BT76 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
UPK3BQ9BT76 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
UPK3BQ9BT76 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
UPK3BQ9BT76 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
UPK3BQ9BT76 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
UPK3BQ9BT76 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
UPK3BQ9BT76 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
UPK3BQ9BT76 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
UPK3BQ9BT76 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
UPK3BQ9BT76 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
UPK3BQ9BT76 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
UPK3BQ9BT76 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
UPK3BQ9BT76 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
UPK3BQ9BT76 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
UPK3BQ9BT76 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
UPK3BQ9BT76 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
UPK3BQ9BT76 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
UPK3BQ9BT76 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
UPK3BQ9BT76 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
UPK3BQ9BT76 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
UPK3BQ9BT76 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
UPK3BQ9BT76 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
UPK3BQ9BT76 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
UPK3BQ9BT76 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
UPK3BQ9BT76 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
UPK3BQ9BT76 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
UPK3BQ9BT76 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
UPK3BQ9BT76 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
UPK3BQ9BT76 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC10.99□□□□□ -0.65
UPK3BQ9BT76 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
UPK3BQ9BT76 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
UPK3BQ9BT76 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
UPK3BQ9BT76 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
UPK3BQ9BT76 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
UPK3BQ9BT76 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
UPK3BQ9BT76 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
UPK3BQ9BT76 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
UPK3BQ9BT76 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
UPK3BQ9BT76 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
UPK3BQ9BT76 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
UPK3BQ9BT76 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC10.99□□□□□ -0.65
UPK3BQ9BT76 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
UPK3BQ9BT76 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
UPK3BQ9BT76 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
UPK3BQ9BT76 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
UPK3BQ9BT76 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
UPK3BQ9BT76 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
UPK3BQ9BT76 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
UPK3BQ9BT76 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
UPK3BQ9BT76 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
UPK3BQ9BT76 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
UPK3BQ9BT76 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
UPK3BQ9BT76 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
UPK3BQ9BT76 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
UPK3BQ9BT76 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
UPK3BQ9BT76 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
UPK3BQ9BT76 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
UPK3BQ9BT76 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
UPK3BQ9BT76 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
UPK3BQ9BT76 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
UPK3BQ9BT76 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
UPK3BQ9BT76 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
UPK3BQ9BT76 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
UPK3BQ9BT76 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
UPK3BQ9BT76 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
UPK3BQ9BT76 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
UPK3BQ9BT76 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
UPK3BQ9BT76 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
UPK3BQ9BT76 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
UPK3BQ9BT76 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
UPK3BQ9BT76 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
UPK3BQ9BT76 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
UPK3BQ9BT76 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
UPK3BQ9BT76 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
UPK3BQ9BT76 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
UPK3BQ9BT76 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
UPK3BQ9BT76 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
UPK3BQ9BT76 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
UPK3BQ9BT76 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
UPK3BQ9BT76 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
UPK3BQ9BT76 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
UPK3BQ9BT76 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
UPK3BQ9BT76 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
UPK3BQ9BT76 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
UPK3BQ9BT76 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
UPK3BQ9BT76 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
UPK3BQ9BT76 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
UPK3BQ9BT76 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
UPK3BQ9BT76 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
UPK3BQ9BT76 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
UPK3BQ9BT76 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
UPK3BQ9BT76 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
UPK3BQ9BT76 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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