Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF0

RAB3IP, Rab-3A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IPQ96QF0 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB3IPQ96QF0 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms