Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ69

C11orf40, Putative uncharacterized protein C11orf40, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf40Q8WZ69 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
C11orf40Q8WZ69 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms