Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
CCDC50Q8IVM0 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC50Q8IVM0 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC50Q8IVM0 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC50Q8IVM0 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC50Q8IVM0 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC50Q8IVM0 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC50Q8IVM0 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC50Q8IVM0 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC50Q8IVM0 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC50Q8IVM0 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC50Q8IVM0 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC50Q8IVM0 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC50Q8IVM0 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC50Q8IVM0 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC50Q8IVM0 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC50Q8IVM0 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC50Q8IVM0 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC50Q8IVM0 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC50Q8IVM0 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC50Q8IVM0 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC50Q8IVM0 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC50Q8IVM0 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC50Q8IVM0 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC50Q8IVM0 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC50Q8IVM0 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC50Q8IVM0 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC50Q8IVM0 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC50Q8IVM0 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC50Q8IVM0 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC50Q8IVM0 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC50Q8IVM0 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC50Q8IVM0 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC50Q8IVM0 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC50Q8IVM0 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC50Q8IVM0 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC50Q8IVM0 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC50Q8IVM0 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC50Q8IVM0 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC50Q8IVM0 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC50Q8IVM0 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC50Q8IVM0 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC50Q8IVM0 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC50Q8IVM0 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC50Q8IVM0 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC50Q8IVM0 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC50Q8IVM0 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC50Q8IVM0 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC50Q8IVM0 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC50Q8IVM0 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC50Q8IVM0 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC50Q8IVM0 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC50Q8IVM0 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC50Q8IVM0 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC50Q8IVM0 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC50Q8IVM0 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC50Q8IVM0 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC50Q8IVM0 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC50Q8IVM0 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC50Q8IVM0 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC50Q8IVM0 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC50Q8IVM0 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC50Q8IVM0 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC50Q8IVM0 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC50Q8IVM0 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC50Q8IVM0 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC50Q8IVM0 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC50Q8IVM0 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC50Q8IVM0 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC50Q8IVM0 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC50Q8IVM0 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC50Q8IVM0 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC50Q8IVM0 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC50Q8IVM0 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC50Q8IVM0 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC50Q8IVM0 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC50Q8IVM0 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC50Q8IVM0 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC50Q8IVM0 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC50Q8IVM0 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC50Q8IVM0 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC50Q8IVM0 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC50Q8IVM0 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC50Q8IVM0 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC50Q8IVM0 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC50Q8IVM0 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC50Q8IVM0 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC50Q8IVM0 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC50Q8IVM0 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC50Q8IVM0 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC50Q8IVM0 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC50Q8IVM0 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC50Q8IVM0 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC50Q8IVM0 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC50Q8IVM0 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC50Q8IVM0 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC50Q8IVM0 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC50Q8IVM0 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC50Q8IVM0 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC50Q8IVM0 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms