Protein–RNA interactions for Protein: Q7KZ85

SUPT6H, Transcription elongation factor SPT6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUPT6HQ7KZ85 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SUPT6HQ7KZ85 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SUPT6HQ7KZ85 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SUPT6HQ7KZ85 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SUPT6HQ7KZ85 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SUPT6HQ7KZ85 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SUPT6HQ7KZ85 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SUPT6HQ7KZ85 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SUPT6HQ7KZ85 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SUPT6HQ7KZ85 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SUPT6HQ7KZ85 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SUPT6HQ7KZ85 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SUPT6HQ7KZ85 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SUPT6HQ7KZ85 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SUPT6HQ7KZ85 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SUPT6HQ7KZ85 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SUPT6HQ7KZ85 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SUPT6HQ7KZ85 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SUPT6HQ7KZ85 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SUPT6HQ7KZ85 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SUPT6HQ7KZ85 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SUPT6HQ7KZ85 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SUPT6HQ7KZ85 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SUPT6HQ7KZ85 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SUPT6HQ7KZ85 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SUPT6HQ7KZ85 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SUPT6HQ7KZ85 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SUPT6HQ7KZ85 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SUPT6HQ7KZ85 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SUPT6HQ7KZ85 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SUPT6HQ7KZ85 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SUPT6HQ7KZ85 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SUPT6HQ7KZ85 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SUPT6HQ7KZ85 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SUPT6HQ7KZ85 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SUPT6HQ7KZ85 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SUPT6HQ7KZ85 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SUPT6HQ7KZ85 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SUPT6HQ7KZ85 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SUPT6HQ7KZ85 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SUPT6HQ7KZ85 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SUPT6HQ7KZ85 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SUPT6HQ7KZ85 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SUPT6HQ7KZ85 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SUPT6HQ7KZ85 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SUPT6HQ7KZ85 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SUPT6HQ7KZ85 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SUPT6HQ7KZ85 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SUPT6HQ7KZ85 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SUPT6HQ7KZ85 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SUPT6HQ7KZ85 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SUPT6HQ7KZ85 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SUPT6HQ7KZ85 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SUPT6HQ7KZ85 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SUPT6HQ7KZ85 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SUPT6HQ7KZ85 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SUPT6HQ7KZ85 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SUPT6HQ7KZ85 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SUPT6HQ7KZ85 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SUPT6HQ7KZ85 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SUPT6HQ7KZ85 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SUPT6HQ7KZ85 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SUPT6HQ7KZ85 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SUPT6HQ7KZ85 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SUPT6HQ7KZ85 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SUPT6HQ7KZ85 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SUPT6HQ7KZ85 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SUPT6HQ7KZ85 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SUPT6HQ7KZ85 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SUPT6HQ7KZ85 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SUPT6HQ7KZ85 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SUPT6HQ7KZ85 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SUPT6HQ7KZ85 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SUPT6HQ7KZ85 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SUPT6HQ7KZ85 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SUPT6HQ7KZ85 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SUPT6HQ7KZ85 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SUPT6HQ7KZ85 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SUPT6HQ7KZ85 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SUPT6HQ7KZ85 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SUPT6HQ7KZ85 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SUPT6HQ7KZ85 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SUPT6HQ7KZ85 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SUPT6HQ7KZ85 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SUPT6HQ7KZ85 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SUPT6HQ7KZ85 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SUPT6HQ7KZ85 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SUPT6HQ7KZ85 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SUPT6HQ7KZ85 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SUPT6HQ7KZ85 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SUPT6HQ7KZ85 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SUPT6HQ7KZ85 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SUPT6HQ7KZ85 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SUPT6HQ7KZ85 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SUPT6HQ7KZ85 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SUPT6HQ7KZ85 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SUPT6HQ7KZ85 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SUPT6HQ7KZ85 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SUPT6HQ7KZ85 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SUPT6HQ7KZ85 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms