Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATL3Q6DD88 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms