Protein–RNA interactions for Protein: Q4VX76

SYTL3, Synaptotagmin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL3Q4VX76 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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