Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL40Q2TBA0 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms