Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
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ZNF239Q16600 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
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ZNF239Q16600 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
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ZNF239Q16600 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
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ZNF239Q16600 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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ZNF239Q16600 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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ZNF239Q16600 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
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