Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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BRD3Q15059 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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BRD3Q15059 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
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BRD3Q15059 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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BRD3Q15059 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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BRD3Q15059 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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BRD3Q15059 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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