Protein–RNA interactions for Protein: Q13094

LCP2, Lymphocyte cytosolic protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCP2Q13094 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LCP2Q13094 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LCP2Q13094 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LCP2Q13094 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LCP2Q13094 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LCP2Q13094 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LCP2Q13094 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LCP2Q13094 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LCP2Q13094 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LCP2Q13094 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LCP2Q13094 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LCP2Q13094 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LCP2Q13094 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LCP2Q13094 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LCP2Q13094 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LCP2Q13094 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LCP2Q13094 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LCP2Q13094 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LCP2Q13094 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LCP2Q13094 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LCP2Q13094 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LCP2Q13094 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LCP2Q13094 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LCP2Q13094 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LCP2Q13094 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LCP2Q13094 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LCP2Q13094 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LCP2Q13094 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LCP2Q13094 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LCP2Q13094 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LCP2Q13094 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LCP2Q13094 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LCP2Q13094 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LCP2Q13094 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LCP2Q13094 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LCP2Q13094 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LCP2Q13094 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LCP2Q13094 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LCP2Q13094 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LCP2Q13094 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LCP2Q13094 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LCP2Q13094 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LCP2Q13094 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LCP2Q13094 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LCP2Q13094 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LCP2Q13094 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LCP2Q13094 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LCP2Q13094 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LCP2Q13094 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LCP2Q13094 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LCP2Q13094 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LCP2Q13094 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LCP2Q13094 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LCP2Q13094 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LCP2Q13094 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LCP2Q13094 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LCP2Q13094 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LCP2Q13094 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LCP2Q13094 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LCP2Q13094 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LCP2Q13094 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LCP2Q13094 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LCP2Q13094 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LCP2Q13094 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LCP2Q13094 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LCP2Q13094 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LCP2Q13094 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LCP2Q13094 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LCP2Q13094 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LCP2Q13094 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LCP2Q13094 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LCP2Q13094 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LCP2Q13094 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LCP2Q13094 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LCP2Q13094 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LCP2Q13094 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LCP2Q13094 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LCP2Q13094 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LCP2Q13094 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LCP2Q13094 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LCP2Q13094 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LCP2Q13094 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LCP2Q13094 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LCP2Q13094 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LCP2Q13094 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LCP2Q13094 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LCP2Q13094 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LCP2Q13094 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LCP2Q13094 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LCP2Q13094 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LCP2Q13094 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LCP2Q13094 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LCP2Q13094 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LCP2Q13094 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LCP2Q13094 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LCP2Q13094 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LCP2Q13094 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LCP2Q13094 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LCP2Q13094 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LCP2Q13094 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms