Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CGNL1Q0VF96 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms