Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms