Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCNT1Q02742 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms