Protein–RNA interactions for Protein: Q02161

RHD, Blood group Rh(D) polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHDQ02161 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHDQ02161 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHDQ02161 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHDQ02161 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHDQ02161 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHDQ02161 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHDQ02161 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHDQ02161 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHDQ02161 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHDQ02161 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHDQ02161 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHDQ02161 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHDQ02161 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHDQ02161 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHDQ02161 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHDQ02161 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHDQ02161 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHDQ02161 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHDQ02161 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHDQ02161 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHDQ02161 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RHDQ02161 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHDQ02161 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHDQ02161 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHDQ02161 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHDQ02161 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHDQ02161 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RHDQ02161 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHDQ02161 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHDQ02161 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RHDQ02161 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHDQ02161 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHDQ02161 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHDQ02161 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHDQ02161 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHDQ02161 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RHDQ02161 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHDQ02161 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHDQ02161 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHDQ02161 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHDQ02161 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHDQ02161 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHDQ02161 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHDQ02161 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHDQ02161 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHDQ02161 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RHDQ02161 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RHDQ02161 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHDQ02161 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHDQ02161 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHDQ02161 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHDQ02161 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHDQ02161 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHDQ02161 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHDQ02161 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHDQ02161 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHDQ02161 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHDQ02161 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHDQ02161 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHDQ02161 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHDQ02161 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHDQ02161 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHDQ02161 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHDQ02161 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHDQ02161 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHDQ02161 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHDQ02161 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHDQ02161 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHDQ02161 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHDQ02161 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHDQ02161 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHDQ02161 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHDQ02161 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHDQ02161 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHDQ02161 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHDQ02161 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHDQ02161 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHDQ02161 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHDQ02161 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHDQ02161 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RHDQ02161 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHDQ02161 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHDQ02161 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RHDQ02161 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHDQ02161 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RHDQ02161 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHDQ02161 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHDQ02161 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHDQ02161 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHDQ02161 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHDQ02161 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHDQ02161 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHDQ02161 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHDQ02161 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RHDQ02161 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHDQ02161 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHDQ02161 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHDQ02161 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHDQ02161 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHDQ02161 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms