Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms