Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRF9Q00978 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms