Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
HERVK_113P62684 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms