Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTDSS1P48651 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms