Protein–RNA interactions for Protein: P29074

PTPN4, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN4P29074 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPN4P29074 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPN4P29074 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPN4P29074 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPN4P29074 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPN4P29074 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPN4P29074 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPN4P29074 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPN4P29074 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPN4P29074 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPN4P29074 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPN4P29074 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPN4P29074 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PTPN4P29074 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PTPN4P29074 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PTPN4P29074 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PTPN4P29074 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PTPN4P29074 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PTPN4P29074 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PTPN4P29074 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PTPN4P29074 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PTPN4P29074 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PTPN4P29074 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPN4P29074 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPN4P29074 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPN4P29074 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPN4P29074 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPN4P29074 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPN4P29074 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPN4P29074 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPN4P29074 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPN4P29074 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPN4P29074 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPN4P29074 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPN4P29074 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPN4P29074 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPN4P29074 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPN4P29074 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPN4P29074 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPN4P29074 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPN4P29074 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPN4P29074 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPN4P29074 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPN4P29074 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPN4P29074 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPN4P29074 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPN4P29074 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPN4P29074 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPN4P29074 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPN4P29074 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPN4P29074 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPN4P29074 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPN4P29074 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPN4P29074 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPN4P29074 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPN4P29074 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPN4P29074 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPN4P29074 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPN4P29074 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPN4P29074 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPN4P29074 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPN4P29074 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPN4P29074 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPN4P29074 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPN4P29074 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPN4P29074 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPN4P29074 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPN4P29074 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPN4P29074 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPN4P29074 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPN4P29074 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPN4P29074 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPN4P29074 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPN4P29074 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPN4P29074 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPN4P29074 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPN4P29074 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPN4P29074 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPN4P29074 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPN4P29074 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPN4P29074 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPN4P29074 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPN4P29074 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPN4P29074 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPN4P29074 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPN4P29074 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPN4P29074 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPN4P29074 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPN4P29074 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPN4P29074 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPN4P29074 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPN4P29074 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPN4P29074 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPN4P29074 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPN4P29074 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPN4P29074 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPN4P29074 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPN4P29074 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPN4P29074 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPN4P29074 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms