Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
DNMT1P26358 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms